Nella piattaforma di microscopia è allocato il Microscopio confocale Nikon A1R.
Grazie al microscopio ottico confocale Nikon A1R, con possibilità di scansione classica (galvanometrica) e Resonant (per acquisizioni ad elevata risoluzione temporale), è possibile eseguire l’imaging di strutture biologiche isolate o in situ, con notevole miglioramento del contrasto e della risoluzione spaziale rispetto alle tecniche di microscopia ottica classica.
Il microscopio è inoltre dotato di fotocamera per acquisizioni in epifluorescenza e di un microincubatore per misure sperimentali con controllo di CO2 e temperatura.